
使用具有Altami Studio软件的FLIR / PGR相机对神经干细胞进行实时分析
我是加州大学学术研究实验室的副教授。 我们的实验室开展干细胞分化工作,以产生各种神经细胞类型。 为了拍摄实时图像,我们的实验室使用连接到FLIR Blackfly U3-23S6C 2.3 MP Color USB3.0相机的Olympus倒置显微镜(IX70)。 该相机配有Sony IMX249传感器,可拍摄明场和荧光图像。 不幸的是,PGR软件(Flycapture)不太适合显微镜检查。 因此,我们寻找用于采集和图像测量的替代软件,这对我们的工作至关重要。 我们的研究使我们通过Altami电子解决方案(Alelso)进入Altami Studio。 该软件似乎最适合我们的需求,因为它是为显微镜应用而构建的。 我们测试了该软件,以评估其适用性以及与我们的显微镜和FLIR(Point Grey)相机的兼容性。
我们发现的第一件事是,在安装时,软件很容易识别相机,这是该软件与该系列相机兼容的一个非常好的迹象。 这使我们的生活变得非常轻松,因为根本没有涉及故障排除。 Altami Studio 不仅可以检测到基本的相机选项,还可以轻松识别各种兼容模式,包括2X2分档模式以及相机的模式0和模式7(参见下图)。
采集和校准
该软件非常易于使用,我们的研究团队发现,与Point Grey Research / FLIR相机附带的软件相比,各种采集选项不言自明。 如果需要,它可以捕获静止图像以及间隔拍摄视频。
我们可以使用千分尺和相机的各种模式轻松设置各种相机物镜的各种校准文件,如上图所示。 使用此功能,我们可以在采集期间或之后轻松将校准应用于单个图像。 这对于点之间的测量和将比例尺应用于图像非常有用(见下图)。
以下是使用Altami Studio软件拍摄的神经干细胞集落的一些示例图像。 相机的宽动态范围加上匹配的兼容性使我们能够从相机捕获清晰明场图像和匹配培养细胞的荧光图像。
使用所有设置的自动模式拍摄上述图像。 这些显示了软件能够适应进入相机的不同光线水平。
该软件还允许用户以多种不同的格式保存文件,包括TIFF,BMP,JPEG以及Altami原生格式。
过滤器和全景
对于显微镜应用非常有用的其他特征之一是能够根据需要将各种滤波器应用于图像。 该软件附带了许多预装在软件中的过滤器。 根据相机的类型,可以使用灰度变换。 还有一种生成用户定义的过滤器的能力,我们还没有测试过,但看看它是如何工作的将会很有趣。 “缩放栏”选项允许编辑缩放栏的字体和大小。
最后,对于显微镜非常有用的选项之一是能够将从各个视场拍摄的图像拼接在一起以生成整个场的更大图像。 这可以使用工具下的全景选项来完成。 这是软件真正擅长的地方。 下面是一个这样的图像的示例,我们能够在几分钟内从图像左侧的各个面板轻松捕获。 选项工具包括Multi-Focus,它对3D结构很有用。
结论
到目前为止,我们使用该软件,我们惊讶于它与我们的第三方相机的相互作用。 该软件使用起来非常快乐,可以在研究实验室环境中平稳地采集显微镜图像。 我们非常感谢您生成此软件,并且无需任何预订即可向任何用户强烈推荐。 我们希望公司继续进一步开发软件并提供持续支持。